南山寺在漳州南郊丹霞山麓。山门宏伟，寺宇巍峨，寺匾“南山寺”三字，雄浑俊逸，是著名古刹，闽南名胜。
南山寺是唐开元（713－741年）年间，太傅陈邕舍宅所献的佛寺。
   陈忠子陈邕，字崇福，号南山，京兆府（现在陕西）万年县洪故乡胄桂里人，生于初唐，唐中宗神龙元年乙巳（705年）中进士，累官至礼部侍郎兼尚书，诰授太子太傅。他与宰相张九龄一同反对唐玄宗于“秋收未毕”时从东都洛阳驾返长安，恐沿途扰民；以及反对玄宗迎寿王妃（玄宗儿媳）杨玉环入居太真宫为女官，恐有悖伦理。因此，与右相李林甫“不协”。唐开元二十四年（736年）张九龄罢相，贬为荆州长史；陈邕谪闽，定居漳州。他在今寺庙所在地建起宅院，在宅院建佛寺“延福报劬南院”。因建钟鼓楼台、殿宇宏阔,踰制，被人参谤，朝庭要派员查办。陈邕四子一女，长陈夷则，次子陈夷锡，当时都在外为官，三子夷行、四子夷实尚年幼。听到朝廷要查消息他急得没了主意。幸年方十八岁女儿金花急中生智，劝父舍宅为寺，全家搬出另居，她自己削发为尼，以保全家消灾避祸。
   陈邕接受女儿建议，献宅为寺，起名“延福禅寺”并请云岭常公尚为主持。金花落发为尼，用她的头发集束写“悠然”二字匾。不久，钦差大臣到达，见这里是寺庙，并非皇宫，便回京复命，免予问罪，消弭了一场灭族之祸。
   安史之乱中，唐肃宗继位聚集力量平乱。肃宗起用老臣，晋升陈邕为光禄大夫兼礼部尚书。邕逝世后，朝廷加谥忠顺王，赐父陈邕为鄂国公。陈邕逝世后，寺僧在他曾住过的地方建祠塑像奉祀，祠内题额“陈太傅祠”。于是，在延福禅寺范围内，就有了一座太傅祠，是派下陈氏子孙祭祀先祖的祖庙。
延福禅寺历代多次修葺，到明朝天启（1621-1627年）年间，始更名为“南山寺”。现在，整个南山寺景区，寺庙和陈太傅祠、金花郡主的修真净室，金花郡主墓，构成一处美丽的名胜。古时候厦门地区的太傅后人每年都要组团乘木帆船顶着风浪渡海到漳州陈太傅祠祭祖，海上行舟，风高浪大，很不安全。
   唐末五代时，七世祖陈喜在厦门岛上资福山下建“资福院”为后院。到南宋末帝1278年，资福院被元兵焚毁。明朝永乐年间，分居同安官山的名宦陈福山与派下陈氏缙绅巨商，择同安县西北隅葫芦麓，兴建同安陈太傅祠，祭祀祖先，绍述祖德。于是，在厦门地区，又有一座陈太傅祠——同安太傅祠。